Andrew Gelman escribió un extenso artículo sobre por qué las pruebas de AB Bayesianas no requieren corrección de hipótesis múltiples: Por qué (generalmente) no tenemos que preocuparnos por las comparaciones múltiples , 2012. No entiendo bien: ¿por qué los métodos bayesianos no requieren múltiples...
Cuando realizamos experimentos (en tamaños de muestra pequeños (generalmente el tamaño de muestra por grupo de tratamiento es de aproximadamente 7 ~ 8)) en dos grupos, utilizamos una prueba t para comprobar la diferencia. Sin embargo, cuando realizamos un ANOVA (obviamente para más de dos grupos),...
Tengo dos preguntas sobre cuándo usar un ajuste de Bonferroni: ¿Es apropiado usar un ajuste de Bonferroni en todos los casos de pruebas múltiples? Si se realiza una prueba en un conjunto de datos, se divide ese conjunto de datos en niveles más finos (por ejemplo, se dividen los datos por género)...
Después de realizar el análisis de componentes principales (PCA), quiero proyectar un nuevo vector en el espacio PCA (es decir, encontrar sus coordenadas en el sistema de coordenadas PCA). He calculado PCA en lenguaje R usando prcomp. Ahora debería poder multiplicar mi vector por la matriz de...
Estoy revisando un trabajo que ha realizado> 15 pruebas separadas de 2 x 2 Chi Square. Sugerí que debían corregir las comparaciones múltiples, pero respondieron que todas las comparaciones fueron planificadas y, por lo tanto, esto no es necesario. Siento que esto no debe ser correcto, pero no...
¿Cuál es el método preferido para realizar post-hocs para pruebas dentro de las asignaturas? He visto trabajos publicados en los que se emplea el HSD de Tukey, pero una revisión de Keppel y Maxwell & Delaney sugiere que la probable violación de la esfericidad en estos diseños hace que el...
Escuché que cuando muchas especificaciones del modelo de regresión (por ejemplo, en OLS) se consideran posibilidades para un conjunto de datos, esto causa múltiples problemas de comparación y los valores p y los intervalos de confianza ya no son confiables. Un ejemplo extremo de esto es la...
Mirando una situación ANOVA entre grupos, ¿qué obtienes al hacer una prueba ANOVA de este tipo primero, y luego hacer pruebas post-hoc (Bonferroni, Šidák, etc.) o comparaciones planificadas? ¿Por qué no omitir el paso ANOVA por completo? Entiendo que en tal situación, el único beneficio de ANOVA...
¿Cuán conservadora es la corrección de pruebas múltiples de Benjamini-Hochberg en relación con el número total de comparaciones? Por ejemplo, si tengo una lista de 18,000 funciones para dos grupos y realizo una prueba de Wilcoxon para obtener un valor p. Ajuste ese valor p usando Benjamini-Hochberg...
He leído este gran artículo de David Colquhoun: Una investigación de la tasa de descubrimiento falso y la mala interpretación de los valores p (2014). En esencia, explica por qué la tasa de descubrimiento falso (FDR) puede ser tan alta como a pesar de que controlamos el error tipo I con .α = 0.0530...
Lectura de estadísticas de descubrimientos de campo utilizando SPSS (3ª edición) Me sorprendió un poco acerca de las pruebas post-hoc en ANOVA. Para aquellos que quieran controlar la tasa de error Tipo I, sugiere Bonferroni o Tukey y dice (p. 374): Bonferroni tiene más poder cuando el número de...
Tanto en la literatura de la tasa de error familiar (FWER) como de la tasa de descubrimiento falso (FDR), se dice que métodos particulares para controlar FWER o FDR son apropiados para pruebas dependientes o independientes. Por ejemplo, en el artículo de 1979 "Un procedimiento de prueba múltiple...
Realicé una evaluación por computadora de diferentes métodos para ajustar un tipo particular de modelo utilizado en las ciencias paleo. Tenía un conjunto de entrenamiento de gran tamaño y, por lo tanto, al azar (muestreo aleatorio estratificado) dejé de lado un conjunto de prueba. Ajusté diferentes...
Me gustaría calcular la medida de similitud entre dos conjuntos ordenados de puntos, los que están en Usuario en comparación con los que están en Maestro : Los puntos son curvas en el espacio 3D, pero estaba pensando que el problema se simplifica si los trazo en 2 dimensiones como en la imagen....
He leído que controlar FDR es menos estricto que controlar FWER, como en Wikipedia : Los procedimientos de control de FDR ejercen un control menos estricto sobre el descubrimiento falso en comparación con los procedimientos de tasa de error familiar (FWER) (como la corrección de Bonferroni)....
Las pruebas de permutación (también llamadas prueba de aleatorización, prueba de aleatorización o prueba exacta) son muy útiles y resultan útiles cuando t-testno se cumple el supuesto de distribución normal requerido por ejemplo y cuando se transforman los valores mediante la clasificación de...
Estoy analizando un conjunto de datos utilizando un modelo de efectos mixtos con un efecto fijo (condición) y dos efectos aleatorios (participante debido al diseño del sujeto y al par). El modelo se ha generado con el lme4paquete:
Me dieron datos para analizar en un estudio que analizaba los efectos de un tratamiento sobre los niveles de hierro en cuatro puntos de tiempo diferentes (antes del tratamiento, el día en que finalizó el tratamiento, 4 semanas después del tratamiento y 2-4 meses después del tratamiento). No hay...
Entiendo el procedimiento y lo que controla. Entonces, ¿cuál es la fórmula para el valor p ajustado en el procedimiento BH para comparaciones múltiples? Justo ahora me di cuenta de que el BH original no producía valores p ajustados, solo ajustaba la condición de (no) rechazo:...
Para evaluar el rendimiento de un nuevo algoritmo clasificador, estoy tratando de comparar la precisión y la complejidad (big-O en entrenamiento y clasificación). De Machine Learning: una revisión obtengo una lista completa de clasificadores supervisados, también una tabla de precisión entre los...