La muestra de Gibbs es una forma simple de simulación de Markov Chain Monte Carlo, ampliamente utilizada en estadísticas bayesianas, basada en el muestreo de distribuciones condicionales completas para cada variable o grupo de variables. El nombre proviene del método que Geman y Geman (1984) utilizaron por primera vez en el modelado de imágenes de campos aleatorios de Gibbs.
Estoy a punto de probar un entorno de estilo BUGS para estimar modelos bayesianos. ¿Hay alguna ventaja importante a considerar al elegir entre OpenBugs o JAGS? ¿Es probable que uno reemplace al otro en el futuro previsible? Usaré el Gibbs Sampler elegido con R. Todavía no tengo una aplicación...
He estado tratando de aprender métodos MCMC y me he encontrado con el muestreo de Metropolis Hastings, Gibbs, Importancia y Rechazo. Si bien algunas de estas diferencias son obvias, es decir, cómo Gibbs es un caso especial de Metropolis Hastings cuando tenemos los condicionales completos, las otras...
Quiero aprender cómo funciona Gibbs Sampling y estoy buscando un buen papel básico a intermedio. Tengo experiencia en informática y conocimientos básicos de estadística. ¿Alguien ha leído buen material? donde lo
Cuando estoy codificando una simulación de Monte Carlo para algún problema, y el modelo es lo suficientemente simple, uso un libro de texto muy básico de muestreo de Gibbs. Cuando no es posible usar el muestreo de Gibbs, codifico el libro de texto Metropolis-Hastings que aprendí hace años. El...
Existen diferentes tipos de algoritmos MCMC: Metrópolis-Hastings Gibbs Muestra de importancia / rechazo (relacionado). ¿Por qué se usaría el muestreo de Gibbs en lugar de Metropolis-Hastings? Sospecho que hay casos en los que la inferencia es más manejable con el muestreo de Gibbs que con...
Acabo de leer un poco sobre el muestreo de Gibbs y el algoritmo Metropolis Hastings y tengo un par de preguntas. Según tengo entendido, en el caso del muestreo de Gibbs, si tenemos un gran problema multivariado, tomamos muestras de la distribución condicional, es decir, tomamos muestras de una...
Según la autoridad suprema 1, Gibbs Sampling es un caso especial del algoritmo Metropolis-Hastings para el muestreo de Markov Chain Monte Carlo. El algoritmo MH siempre proporciona una probabilidad de transición con la propiedad de balance detallada; Espero que Gibbs también lo haga. Entonces,...
Estaba revisando la documentación de Stan que se puede descargar desde aquí . Estaba particularmente interesado en su implementación del diagnóstico Gelman-Rubin. El artículo original Gelman y Rubin (1992) define el factor de reducción de escala potencial (PSRF) de la siguiente manera: Deje que...
Los algoritmos MCMC como el muestreo de Metropolis-Hastings y Gibbs son formas de muestreo de las distribuciones posteriores conjuntas. Creo que entiendo y puedo implementar la aceleración de las metrópolis con bastante facilidad: simplemente elige los puntos de partida de alguna manera y...
Estoy reproduciendo desde cero los resultados en la Sección 4.2.1 de Probabilidad marginal de la salida de Gibbs Siddhartha Chib Revista de la Asociación Americana de Estadística, vol. 90, núm. 432. (diciembre de 1995), págs. 1313-1321. Es una mezcla de modelos normales con el número conocido...
En el libro de Gelman & Hill (2007) (Análisis de datos utilizando regresión y modelos multinivel / jerárquicos), los autores afirman que incluir parámetros medios redundantes puede ayudar a acelerar MCMC. El ejemplo dado es un modelo no anidado de "simulador de vuelo" (Ec....
Suponga que tiene una variable explicativa donde representa una coordenada dada. También tiene una variable de respuesta . Ahora, podemos combinar ambas variables como:X=(X(s1),…,X(sn))X=(X(s1),…,X(sn)){\bf{X}} = \left(X(s_{1}),\ldots,X(s_{n})\right)sssY=(Y(s1),…,Y(sn))Y=(Y(s1),…,Y(sn)){\bf{Y}} =...
Según tengo entendido, lo es (al menos, así es como lo define Wikipedia ). Pero he encontrado esta declaración de Efron * (énfasis agregado): La cadena de Markov Monte Carlo (MCMC) es la gran historia de éxito de las estadísticas bayesianas modernas. MCMC y su método hermano "muestreo de Gibbs"...
Pregunta de tarea: Considere el modelo Ising 1-d. Deje . es -1 o +1x=(x1,...xd)x=(x1,...xd)x = (x_1,...x_d)xixix_i π(x)∝e∑39i=1xixi+1π(x)∝e∑i=139xixi+1\pi(x) \propto e^{\sum_{i=1}^{39}x_ix_{i+1}} Diseñe un algoritmo de muestreo de gibbs para generar muestras aproximadamente a partir de la...
De hecho, estoy dudando en preguntar esto, porque me temo que me remitirán a otras preguntas o a Wikipedia sobre el muestreo de Gibbs, pero no tengo la sensación de que describan lo que está a la mano. Dada una probabilidad condicional : p ( x | y ) y = y 0 y = y 1 x = x 0 1p ( x |...
Parece que los condicionales completos a menudo son bastante difíciles de obtener, sin embargo, programas como JAGS y BUGS los obtienen automáticamente. ¿Alguien puede explicar cómo generan algorítmicamente condicionales completos para cualquier especificación de modelo
Los antecedentes de mi estudio : En un muestreo de Gibbs donde tomamos muestras de (la variable de intereses) e de y respectivamente, donde e son vectores aleatorios dimensionales. Sabemos que el proceso generalmente se divide en dos
Encontré este artículo donde dice que en el muestreo de Gibbs se acepta cada muestra. Estoy un poco confundido. ¿Cómo es que si cada muestra que aceptaba converge a una distribución estacionaria? En general, el algoritmo Metropolis aceptamos como min (1, p (x *) / p (x)) donde x * es el punto de...
Actualmente estoy estimando un modelo de volatilidad estocástica con los métodos de Markov Chain Monte Carlo. De este modo, estoy implementando los métodos de muestreo de Gibbs y Metropolis. Suponiendo que tomo la media de la distribución posterior en lugar de una muestra aleatoria, ¿es esto lo que...
Entonces, tengo 16 ensayos en los que estoy tratando de autenticar a una persona de un rasgo biométrico usando Hamming Distance. Mi umbral está establecido en 3.5. Mis datos están a continuación y solo la prueba 1 es un verdadero positivo: Trial Hamming Distance 1 0.34 2 0.37 3 0.34 4 0.29 5...