Preguntas etiquetadas con petsc

Tengo que resolver varios problemas desafiantes de optimización global no convexo. Actualmente uso la Caja de herramientas de optimización de MATLAB (específicamente, fmincon()con algoritmo = 'sqp'), que es bastante eficaz . Sin embargo, la mayor parte de mi código está en Python, y me encantaría...

¿Qué puede salir mal cuando se utilizan los métodos de Krylov preconditonado de KSP ( paquete de solucionador lineal de PETSc ) para resolver un sistema lineal disperso como los obtenidos al discretizar y linealizar ecuaciones diferenciales parciales? ¿Qué pasos puedo tomar para determinar qué...

Por lo que puedo decir, los dos grandes marcos genéricos de software de ciencia computacional del Departamento de Energía de EE . UU . Son PETSc y Trilinos . Parecen similares a primera vista, más allá de las diferencias en el lenguaje (C versus C ++). ¿Cuáles son las principales diferencias entre...

Estoy usando el paquete de solución no lineal de PETSc SNES para resolver un sistema de ecuaciones no lineales obtenidas al discretizar una ecuación diferencial parcial. ¿Cómo puedo determinar por qué el solucionador no converge y qué puedo hacer para resolver con éxito mis...

Estoy planeando usar multirredes para calcular algunos valores y vectores propios, y noté que PETSc tiene soporte de alto nivel para multirredes. La documentación de PETSc dice que esta parte de PETSc no debe usarse, ya que se reemplazará pronto. ¿Qué otras bibliotecas tienen soporte de alto nivel...

Me gustaría saber si hay una manera rápida de calcular la distancia euclidiana de dos vectores en Octave. Parece que no hay una función especial para eso, así que ¿debería usar la fórmula con

Tengo un PETSc Maty me gustaría estimar su número de

Dondequiera que haya visto, el tutorial / documentos de PETSc, etc., dicen que es útil para el álgebra lineal y generalmente especifica que los sistemas dispersos se beneficiarán. ¿Qué pasa con las matrices densas? Me preocupa resolver para A densa .A x = bUNX=siAx=bUNUNA He escrito mi propio...

Estaba jugando con PETSc y noté que cuando ejecuto mi programa con más de un proceso a través de MPI , ¡parece funcionar aún más lento ! ¿Cómo puedo verificar para ver qué está

Por lo general, escribo código de serie, y cuando lo hago, escribo pruebas unitarias con un marco de prueba de estilo xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose o el marco de prueba C ++ de Google). Basado en una búsqueda superficial de Google, no he visto mucho sobre cómo los profesionales unen el código...

Pregunta: ¿Qué métodos están disponibles para calcular con precisión y eficiencia la estructura de dispersión de una matriz de elementos finitos? Información: estoy trabajando en un solucionador de ecuaciones de presión de Poisson, usando el método de Galerkin con una base cuadrática de Lagrange,...

Mi sistema es un problema de FE simétrico con multiplicadores lagrange (por ejemplo, flujo incompresible de Stokes): (ABBTC)(ABTBC)\begin{pmatrix}A & B^T \\ B & C\end{pmatrix} donde es el caso típico (incluso me he asegurado de que las ecuaciones estén numeradas para que los multiplicadores de...

Necesito resolver el mismo sistema lineal disperso (300x300 a 1000x1000) con muchos lados derechos (300 a 1000). Además de este primer problema, también me gustaría resolver diferentes sistemas, pero con los mismos elementos distintos de cero (solo valores diferentes), es decir, muchos sistemas...

Aquí hay un uso típico de los punteros de función en C. Me gustaría hacer algo similar en Fortran. Tengo algunas ideas, pero me gustaría saber si hay alguna forma canónica de hacerlo. Los punteros de función y los contextos pasados ​​por el usuario se almacenan y luego se llaman más...

¿Cuánto más lento es petsc4py vs c / c ++ / fortran? Me doy cuenta de que dependerá significativamente del código que se ejecute, pero ¿qué pasa con algo simple como un producto de matriz de

¿Compilar PETSc con una biblioteca externa BLAS / LAPACK afecta significativamente el rendimiento en matrices dispersas, o solo usa esas bibliotecas para matemáticas de matriz

Soy muy nuevo en la programación GPGPU, así que perdónenme si la pregunta no es particularmente apropiada. Por lo que entiendo, la programación de GPU es un trabajo de ingeniería muy complejo en comparación con la programación habitual de CPU. Hay que tener mucho cuidado con los problemas de...

Soy nuevo en el paquete PETSc. Tengo un ~ 4000x4000 matriz A en formato de mercado de matriz y quiero obtener PETSc para resolver esto usando múltiples procesadores. Sé cómo resolver el sistema en un único procesador, pero no sé cómo distribuir la matriz y los vectores entre diferentes...

Básicamente, FEM parece ser un problema que está prácticamente "resuelto". Existen numerosos marcos potentes, como Trilinos, PETSc, FEniCS, Libmesh o MOOSE. Una cosa que tienen en común: son extremadamente "pesados". Primero, la instalación normalmente es muy dolorosa. En segundo lugar, su...

Me estoy sumergiendo en el fascinante mundo del análisis de elementos finitos y me gustaría resolver un gran problema termomecánico (solo térmico mecánico, sin retroalimentación).→→\rightarrow Para el problema mecánico, ya entendí por la respuesta de Geoff , que necesitaré usar un solucionador...