Preguntas sobre bibliotecas y software independiente diseñado o adecuado para cálculos científicos o numéricos.
¿Alguien tiene recomendaciones sobre una biblioteca de matriz de C ++ rápida y utilizable? Lo que quiero decir con usable es lo siguiente: Los objetos de matriz tienen una interfaz intuitiva (por ejemplo: puedo usar filas y columnas mientras indexo) Puedo hacer cualquier cosa con la clase de...
Muchas veces, cuando heredé o me encontré con un código científico escrito por otras personas (u ocasionalmente, incluso con mi propio trabajo), noté que la documentación es escasa o inexistente. Si tengo suerte, veo comentarios informativos. Si tengo mucha suerte, incluso hay comentarios de...
El software es una parte fundamental de la ciencia computacional y se reconoce cada vez más como una parte esencial del registro científico. Dado el valor de usar código existente y bien probado, parece que vale la pena comunicar la existencia de códigos útiles lo más ampliamente posible y...
En uno de mis documentos, enumero algunos resultados numéricos además de algunas cifras. Lo que me gustaría hacer es asegurarme de que los resultados numéricos en mi trabajo siempre estén de acuerdo con el código. En este momento, solo copie directamente los resultados numéricos de mi salida de...
No quiero tratar con virtualenv para una instalación local de Python, solo quiero instalar algunos paquetes localmente sin tratar con la PYTHONPATHvariable de entorno, ¿cómo hago
¿Alguien me puede recomendar un buen sistema de gestión de flujo de trabajo (WMS), preferiblemente en Python? Hasta ahora he estado usando GNU Make, pero introduce una capa de complejidad que quiero evitar. Un buen WMS debe tener las siguientes características: integrarse fácilmente con...
El problema Actualmente estoy trabajando en una simulación de elementos finitos Navier Stokes y me gustaría investigar los efectos de una variedad de parámetros. Algunos parámetros se especifican en un archivo de entrada o mediante las opciones de una línea de comando; otros parámetros se...
Los desarrolladores de software tienen la opción de elegir una licencia apropiada de acuerdo con los objetivos del trabajo. ¿Alguien puede dar algunas recomendaciones / experiencias sobre qué licencia elegir para el software? ¿Cuáles son las ventajas y desventajas de "regalar" todo el trabajo...
He estado buscando bibliotecas de álgebra lineal de C ++ para un proyecto en el que he estado trabajando. Algo que aún no entiendo es la conexión de BLAS y LAPACK a otras bibliotecas de álgebra lineal. Al revisar este artículo sobre bibliotecas de álgebra lineal , encontré interesante...
Pregunta relacionada: Estado del sistema operativo Mac en informática científica y HPC Un número significativo de paquetes de software en ciencia computacional están escritos en Fortran, y Fortran no va a desaparecer. También se requiere un compilador Fortran para construir otros paquetes de...
Dada la función real de las variables reales, ¿existe un software disponible que pueda generar automáticamente un código numérico exacto para calcular la función sobre todas las entradas en una máquina equipada con aritmética IEEE 754? Por ejemplo, si la función real a evaluar fuera: El...
No estoy ejecutando ningún código paralelo en este momento, pero preveo ejecutar código paralelo en el futuro usando un híbrido de OpenMP y MPI. Los depuradores han sido herramientas invaluables para mí al ejecutar proyectos en serie. ¿Alguien puede recomendar un depurador paralelo (o múltiples...
Por lo que puedo decir, los dos grandes marcos genéricos de software de ciencia computacional del Departamento de Energía de EE . UU . Son PETSc y Trilinos . Parecen similares a primera vista, más allá de las diferencias en el lenguaje (C versus C ++). ¿Cuáles son las principales diferencias entre...
La reproducibilidad se ha vuelto cada vez más importante en la investigación en ciencias computacionales. (Por ejemplo, vea este artículo de Roger Peng en Science ; también conozco otros artículos y sitios web de este tipo). Sin embargo, no tengo claro cuánta información debo incluir en un artículo...
Esta pregunta se migró de Cross Validated porque se puede responder en Computational Science Stack Exchange. Migrado hace 7 años . Quiero aprender la programación de MATLAB para poder realizar algunas investigaciones / análisis por mi cuenta y también, para poder estudiar...
La investigación reproducible en computación tiene como objetivo hacer que el código necesario para generar los resultados en un documento computacional esté disponible para otros investigadores para que puedan ejecutar este código para reproducir los resultados en ese documento. Me gustaría hacer...
A menudo me encuentro escribiendo código muy similar para versiones de una, dos y tres dimensiones de una operación / algoritmo dado. Mantener todas estas versiones puede volverse tedioso. La generación de código simple funciona bastante bien, pero parece que debe haber una mejor manera. ¿Existe...
En los albores de OS X, parecía haber una gran cantidad de bullicio, al menos en el mundo Mac (no estaba cerca de la informática científica en ese momento) sobre Mac OS como plataforma para la informática científica y las aplicaciones de HPC. XGrid salió de la caja, Virginia Tech tenía su elegante...
Mi tesis es sobre el desarrollo de métodos numéricos para la reducción del modelo en la combustión. Ejecuto mis métodos únicamente en la parte química de las simulaciones de combustión, y tengo muchos estudios de casos para simulaciones 0-D (sin flujo). Lo que me gustaría es ejecutar simulaciones...
La simulación de física múltiple implica el acoplamiento de múltiples "físicas", a menudo con diferentes escalas de espacio y / o tiempo. Además, los códigos de física única a menudo son escritos por diferentes equipos. La técnica de acoplamiento más utilizada es la división del operador de primer...