Preguntas etiquetadas con distance-functions

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Tengo una matriz , donde p es el número de genes yn es el número de pacientes. Cualquiera que haya trabajado con estos datos sabe que p siempre es mayor que n . Usando la selección de características, pude obtener p a un número más razonable, sin embargo, p es aún mayor que nn × pnorte×pagn\times...

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Es el teorema del contraste relativo de Beyer et al. artículo: "¿Sobre el comportamiento sorprendente de las métricas de distancia en el espacio de alta dimensión" engañoso?

Esto se cita muy a menudo cuando se menciona la maldición de la dimensionalidad y va (fórmula de la derecha llamada contraste relativo) limre→ ∞var ( | | XreEl | El |kmi[ | El | XreEl | El |k]) =0,entonces: Dmaxkre- Dminkrereminkre→ 0limre→∞var(El |El |XreEl |El |kmi[El |El |XreEl |El |k])=0...

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¿Cómo comparar los eventos observados con los esperados?

Supongamos que tengo una muestra de frecuencias de 4 eventos posibles: Event1 - 5 E2 - 1 E3 - 0 E4 - 12 y tengo las probabilidades esperadas de que ocurran mis eventos: p1 - 0.2 p2 - 0.1 p3 - 0.1 p4 - 0.6 Con la suma de las frecuencias observadas de mis cuatro eventos (18) puedo calcular las...

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Inestabilidad numérica de cálculo de matriz de covarianza inversa

Tengo 65 muestras de datos de 21 dimensiones (pegados aquí ) y estoy construyendo la matriz de covarianza a partir de ellos. Cuando se calcula en C ++, obtengo la matriz de covarianza pegada aquí . Y cuando se calcula en matlab a partir de los datos (como se muestra a continuación) obtengo la...

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Divergencia de Jensen-Shannon para distribuciones normales bivariadas

Dadas dos distribuciones normales bivariadas y , estoy tratando de calcular la divergencia Jensen-Shannon entre ellos, definido (para el caso discreto) como: donde KLD es la divergencia Kullback-Leibler , y M = \ frac {1} {2} (P + Q) He encontrado la manera de calcular KLD en términos de los...

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Distancia de Mahalanobis entre dos distribuciones bivariadas con diferentes covarianzas

La pregunta está más o menos contenida en el título. ¿Cuál es la distancia de Mahalanobis para dos distribuciones de diferentes matrices de covarianza? Lo que he encontrado hasta ahora supone la misma covarianza para ambas distribuciones, es decir, algo de este tipo: ΔTΣ−1ΔΔTΣ−1Δ\Delta^T...

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