Quiero ajustar un GLMM multinivel con una distribución de Poisson (con sobredispersión) usando R. En este momento estoy usando lme4 pero noté que recientemente la quasipoissonfamilia fue eliminada. He visto en otras partes que puede modelar la sobredispersión aditiva para distribuciones binomiales...
¿Cómo calculo el error relativo cuando el valor verdadero es cero? Digamos que tengo xtrue=0xtrue=0x_{true} = 0 y . Si defino error relativo como:xtestxtestx_{test} relative error=xtrue−xtestxtruerelative error=xtrue−xtestxtrue\text{relative error} = \frac{x_{true}-x_{test}}{x_{true}} Entonces...
Puede tener datos en formato ancho o en formato largo. Esto es bastante importante, ya que los métodos utilizables son diferentes, dependiendo del formato. Sé que tiene que trabajar con melt()y cast()desde el paquete de remodelación, pero parece que hay algunas cosas que no entiendo. ¿Alguien me...
Imagina Ejecuta una regresión lineal con cuatro predictores numéricos (IV1, ..., IV4) Cuando solo se incluye IV1 como predictor, la beta estandarizada es +.20 Cuando también incluye IV2 a IV4, el signo del coeficiente de regresión estandarizado de IV1 cambia -.25(es decir, se vuelve...
¿Es posible visualizar el resultado del análisis de componentes principales de manera que proporcione más información que solo tablas de resumen? ¿Es posible hacerlo cuando el número de observaciones es grande, digamos ~ 1e4? ¿Y es posible hacerlo en R [otros entornos
Estoy tratando de graficar el número de acciones de los usuarios (en este caso, "me gusta") a lo largo del tiempo. Así que tengo "Número de acciones" como mi eje y, mi eje x es el tiempo (semanas) y cada línea representa un usuario. Mi problema es que quiero ver estos datos para un conjunto de...
Contexto: en respuesta a una pregunta anterior sobre investigación reproducible, Jake escribió Un problema que descubrimos al crear nuestro archivo JASA fue que las versiones y los valores predeterminados de los paquetes CRAN cambiaron. Entonces, en ese archivo, también incluimos las versiones...
Entiendo lo que es un posterior, pero no estoy seguro de lo que significa este último. ¿Cómo son los 2 diferentes? Kevin P. Murphy indicó en su libro de texto, Aprendizaje automático: una perspectiva probabilística , que es "un estado de creencia interna". ¿Qué significa eso realmente? Tenía la...
¿Es posible calcular los valores de AIC o BIC para los modelos de regresión de lazo y otros modelos regularizados donde los parámetros solo ingresan parcialmente la ecuación? ¿Cómo se determinan los grados de libertad? Estoy usando R para ajustar los modelos de regresión de lazo con la...
Estoy tratando de analizar algunos datos usando un modelo de efectos mixtos. Los datos que recopilé representan el peso de algunos animales jóvenes de diferentes genotipos a lo largo del tiempo. Estoy usando el enfoque propuesto aquí:
He encontrado algunas distribuciones para las cuales BUGS y R tienen diferentes parametrizaciones: Normal, log-Normal y Weibull. Para cada uno de estos, deduzco que el segundo parámetro utilizado por R debe transformarse inversamente (1 / parámetro) antes de usarse en BUGS (o JAGS en mi caso)....
¿Cuáles son algunas pautas útiles para probar parámetros (es decir, profundidad de interacción, minchild, frecuencia de muestreo, etc.) usando GBM? Digamos que tengo 70-100 características, una población de 200,000 y tengo la intención de probar la profundidad de interacción de 3 y 4. Claramente,...
Mucho se ha escrito sobre las opciones de color amigables para los daltónicos para mapas, polígonos y regiones sombreadas en general (ver, por ejemplo, http://colorbrewer2.org ). No he podido encontrar recomendaciones para colores de línea y grosores de línea variables para gráficos de líneas. Los...
Me gustaría determinar la importancia relativa de los conjuntos de variables para un randomForestmodelo de clasificación en R. La importancefunción proporciona la MeanDecreaseGinimétrica para cada predictor individual: ¿es tan simple como sumar esto en cada predictor de un conjunto? Por...
/ edit: Seguimiento adicional ahora puedes usar irlba :: prcomp_irlba / edit: siguiendo mi propio post. irlbaahora tiene argumentos de "centro" y "escala", que le permiten usarlo para calcular componentes principales, por ejemplo: pc <- M %*% irlba(M, nv=5, nu=0, center=colMeans(M),...
Soy muy nuevo en las estadísticas bayesianas, y esta puede ser una pregunta tonta. Sin embargo: Considere un intervalo creíble con un previo que especifique una distribución uniforme. Por ejemplo, de 0 a 1, donde 0 a 1 representa el rango completo de valores posibles de un efecto. En este caso,...
Quiero generar la trama descrita en el libro ElemStatLearn "Los elementos del aprendizaje estadístico: minería de datos, inferencia y predicción. Segunda edición" de Trevor Hastie y Robert Tibshirani y Jerome Friedman. La trama es: Me pregunto cómo puedo producir este gráfico exacto R,...
Creo que R puede tomar mucho tiempo generar gráficos cuando hay millones de puntos presentes, lo que no es sorprendente dado que los puntos se trazan individualmente. Además, tales tramas a menudo son demasiado desordenadas y densas para ser útiles. Muchos de los puntos se superponen y forman una...
Tengo un gran conjunto de datos y quiero realizar una reducción de dimensionalidad. Ahora, en todas partes, leo que puedo usar PCA para esto. Sin embargo, todavía parece que no sé qué hacer después de calcular / realizar el PCA. En R esto se hace fácilmente con el comando princomp. ¿Pero qué...
Estoy tratando de ponerme al día con R. Finalmente, quiero usar las bibliotecas R para hacer la clasificación de texto. Me preguntaba cuáles son las experiencias de las personas con respecto a la escalabilidad de R cuando se trata de hacer una clasificación de texto. Es probable que me encuentre...