Rama de la química que se ocupa del uso de modelos matemáticos para resolver problemas de química.
Recientemente me encontré con una formulación del meta-fenómeno : " dos es fácil, tres es difícil " (redactado de esta manera por Federico Poloni), que se puede describir de la siguiente manera: Cuando se formula un cierto problema para dos entidades, es relativamente fácil de resolver; sin...
Finalmente has logrado descubrir cómo están dispuestos espacialmente los átomos en tu entidad molecular recién descubierta. A través de, por ejemplo, medios espectroscópicos, ahora está en posesión de un montón de coordenadas de átomos, tipos de átomos, longitudes de enlaces, tipos de enlaces y...
Leí sobre ciencia computacional en Wikipedia, pero mi comprensión no es muy clara. ¿La ciencia computacional involucra programación? ¿Cuán diferente es la ciencia computacional de la computacional _ ____ , donde el espacio en blanco podría ser cualquier disciplina (ciencia de materiales,...
¿Qué es exactamente la corrección de contrapeso? ¿Puedes explicar cuándo es necesario y por
Específicamente, quiero extender el trabajo que involucra B3LYP comenzó con Gaussian 03 pero continuó con GAMESS-US. Las energías proporcionadas por los métodos B3LYP predeterminados no son las mismas. Hay una discusión sobre esto en el manual GAMESS-US (sección de información adicional): Tenga...
¿Hay casos en que Hartree-Fock no es una buena aproximación para calcular la geometría de equilibrio cuando la molécula se encuentra en una condición de ruptura de enlaces?
¿Existe algún algoritmo que enumere las gráficas que corresponden a alguna teselación de puntos de Delaunay en 3D? Si es así, ¿hay una parametrización eficiente de las geometrías que corresponden a cualquier "gráfico de Delaunay"? Estoy buscando enumerar sistemáticamente todas las geometrías...
Las proteínas generalmente se representan en forma de dibujos animados, con láminas β como flechas y hélices α como bobinas: Me pregunto, ¿hay alguna referencia que describa la construcción de esta representación? Es decir, ¿qué objetos matemáticos se utilizan para construir estos gráficos y en...
Soy nuevo en programación y estoy tratando de resolver mi primer gran problema y escribir mi primer gran programa. He buscado ejemplos de código abierto de código para aprender, pero hasta ahora solo he encontrado código en idiomas que no entiendo completamente o que hace cosas relacionadas pero...
Me gustaría visualizar una vibración molecular que no es un modo normal. Me gustaría presentar una representación estática, vectorial del movimiento, y me gustaría cierta flexibilidad en el estilo vectorial (tamaño, color, etc.). También estoy interesado en producir un video de la...
Estoy produciendo imágenes 1d y 2d usando Matlab en este momento para comparar la precisión con un modelo dado. Necesito comparar mis métodos con el modelo gaussiano estándar .wfn y lo haré analizando la densidad de una molécula y la laplaciana. Estoy interesado en producir imágenes en 2D de las...
Se dice que algunos conjuntos de bases son "consistentes en correlación". ¿Qué significa en la
En el método de campo autoconsistente de Hartree-Fock para resolver la ecuación electrónica de Schroedinger independiente del tiempo, buscamos minimizar la energía del estado fundamental, , de un sistema de electrones en un campo externo con respecto a la elección de los orbitales giratorios, { χ i...
Me gustaría probar la influencia de los parámetros de solvatación en los modelos de solvatación implícitos y preguntarme qué códigos están disponibles gratuitamente como programas independientes para el plegamiento de proteínas de proteínas pequeñas, y cuáles usan enfoques de minimización de...
Estoy tratando de modelar la conducción de calor dentro de un cilindro de madera usando métodos implícitos de diferencias finitas. La ecuación de calor general que estoy usando para formas cilíndricas y esféricas es: Donde p es el factor de forma, p = 1 para el cilindro y p = 2 para la esfera....