Bueno, la respuesta a tu pregunta es doble:
Una versión móvil de su sitio web no tendrá un impacto en su versión de escritorio, ya que los sitios están dirigidos a diferentes grupos de usuarios.
Google tiene un bot móvil dedicado, el Googlebot-Mobile. Por lo tanto, este bot rastreará, indexará y clasificará su versión móvil. Dato importante que debe saber si desea que su sitio web móvil se clasifique dentro de los resultados de búsqueda de la búsqueda móvil de Google en dispositivos móviles. Se preferirá la versión móvil de su sitio a la de escritorio en dispositivos móviles.