Comparaciones múltiples en una prueba no paramétrica

11

Estoy trabajando con un conjunto de datos que no es paramétrico y tiene 12 tratamientos. Realicé la prueba de Kruskal-Wallis y obtuve un valor significativo , y ahora me gustaría realizar un procedimiento de comparaciones múltiples para ver cuál de los tratamientos difiere significativamente. Hay mucha información sobre este tema, pero no he encontrado nada que aborde específicamente este problema. ¿¿Algunas ideas?? p

jesse
fuente

Respuestas:

10

Estás buscando la prueba de Dunn (o, digamos, la prueba de Conover-Iman). Esto es muy parecido a un conjunto de pruebas de suma de rango por pares , pero las versiones de Dunn (1) explican la varianza agrupada implicada por la hipótesis nula, y (2) retiene la clasificación utilizada para realizar la prueba de Kruskal-Wallis. Realizar pruebas de suma de rango de variedad de jardín Wilcoxon / Mann-Whitney ignora estos problemas. Por supuesto, se puede realizar una tasa de error familiar o correcciones de tasa de descubrimiento falsas para comparaciones múltiples con la prueba de Dunn.

La prueba de Dunn se implementa para Stata en el paquete dunntest (del tipo Stata net describe dunntest, from(https://alexisdinno.com/stata)mientras está conectado a Internet) y para R en el paquete dunn.test ; ambos paquetes incluyen muchas opciones de ajuste de comparación múltiple. También se podría realizar la prueba de Dunn en SAS utilizando la macro de Elliott y Hynan, KW_MC .

Como escribí en una pregunta relacionada con el CV : hay algunas pruebas por pares post hoc menos conocidas para seguir a un Kruskal-Wallis rechazado, incluido Conover-Iman (como Dunn, pero basado en la distribución t , en lugar de la distribución z , estrictamente más potente que la prueba de Dunn, y también implementado para Stata en el paquete conovertest , y para R en el paquete conover.test ), y las pruebas Dwass-Steel-Citchlow-Fligner.


Referencias
Dunn, OJ (1964). Múltiples comparaciones usando sumas de rango. Technometrics , 6 (3): 241–252.

Alexis
fuente
¿Puedes explicar por qué no usar métodos suaves como "fdr"?
user4581
@ user4581 No estoy seguro de entender tu pregunta. Primero, ¿qué quieres decir con "suave"? En segundo lugar, ¿a qué se refiere con "por qué no"? Uno ciertamente puede usar métodos de tasa de descubrimiento falso para ajustar las comparaciones múltiples con la prueba de Dunn o la prueba de Conover-Iman.
Alexis