Visa recibida en un país, embarque desde otro país

Mi amigo obtuvo una visa para viajar a Japón desde la Embajada de Japón en Nepal. En lugar de abordar desde Nepal, es decir, el aeropuerto de Katmandú, quiere abordar desde India, es decir, Delhi, para venir a Tokio.

¿Está bien o solo necesita embarcar desde Nepal?

Está bien . Las visas son para el país al que vas, no para el país del que vienes.