¿Omitir un programa que se ejecuta antes del escritorio?

Lo que quiero decir con eso es que los programas dicen "se requiere un reinicio para hacer bla" y luego se ejecutan en un modo de bajo nivel antes de que se cargue el sistema operativo la próxima vez que arranque. Ejemplos de esto son Spybot S&D, Norton Ghost, memtest, etc. Me pregunto si hay...