Creé este video usando el siguiente comando FFmpeg :
ffmpeg -i in.ffconcat -c:v libx264 -pix_fmt yuv420p -r 30 out.mp4
El contenido del archivo in.ffconcat es:
ffconcat version 1.0
file caption_01.png
duration 4
file caption_01.png
duration 2
file caption_02.png
duration 5
file caption_03.png
Puedo reproducir el video perfectamente usando Windows Media Player y Chrome, pero usando el reproductor VLC las imágenes se ven inclinadas 
¿Porqué es eso?
video
ffmpeg
images
vlc-media-player
gsi-frank
fuente
fuente

Window>Video Effects>Geometry> DeseleccionarTransform.Respuestas:
Creo que puede tener la rotación establecida en VLC:
Para borrarlo, vaya a:
Tools→Effects and Filters→Video Effects→Geometry→ DesmarqueRotateAlgunas versiones pueden ser diferentes, como:
Window→Video Effects→Geometry→ DesmarqueRotatefuente