¿El video tomado en iPhone aparece en negro cuando se abre en Quicktime, pero está bien cuando se abre en VLC?

Tomé un video en mi iPhone 4S al revés. Busqué en Internet y encontré una publicación que decía que QuickTime Pro de Apple podía rotar / voltear videos sin pérdidas. En primer lugar, ¿es este definitivamente el caso? Mis problemas serían irrelevantes si hubiera otros programas que pudieran cambiar la orientación de mi video manteniendo el 99.99% de la calidad.

Si QuickTime Pro es el único / mejor programa para usar para este propósito, ¿por qué no se muestra la parte de video del archivo? Cuando reproduzco el video en QuickTime, veo un rectángulo negro que ocupa toda la resolución del video y puedo escuchar el audio del video. Si abro el mismo archivo de video en VLC o Windows Media Player, el video aparece bien junto con el audio.

Cualquier software de edición / conversión de video puede hacer esto fácilmente, vlc y Media Player Classic no están diseñados para ello, pero deberían poder voltear / rotar video durante la reproducción.

EDITAR: En cuanto a su segunda pregunta / problema, esto no es sorprendente, Apple puede hacer algunas cosas buenas, pero su software de video y los códecs que los acompañan generalmente no son los mejores, probablemente un problema de códec como VLC viene con son sus propios códecs y mucho más que la mayoría de los reproductores multimedia.