Encuentre el índice entero de filas con NaN en el marco de datos de pandas

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Tengo un DataFrame de pandas como este:

                    a         b
2011-01-01 00:00:00 1.883381  -0.416629
2011-01-01 01:00:00 0.149948  -1.782170
2011-01-01 02:00:00 -0.407604 0.314168
2011-01-01 03:00:00 1.452354  NaN
2011-01-01 04:00:00 -1.224869 -0.947457
2011-01-01 05:00:00 0.498326  0.070416
2011-01-01 06:00:00 0.401665  NaN
2011-01-01 07:00:00 -0.019766 0.533641
2011-01-01 08:00:00 -1.101303 -1.408561
2011-01-01 09:00:00 1.671795  -0.764629

¿Existe una forma eficiente de encontrar el índice "entero" de filas con NaN? En este caso, la salida deseada debería ser [3, 6].

Jean-François Corbett
fuente
12
Si solo desea seleccionar las filas con nan, puede hacerlodf[np.isnan(df['b'])]
lazy1
4
Siguiendo desde @ lazy1 - en lugar de usar numpy's isnantambién puede usardf['b'].isnull()
jmetz

Respuestas:

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Para DataFrame df:

import numpy as np
index = df['b'].index[df['b'].apply(np.isnan)]

le devolverá el MultiIndexque puede usar para indexar de nuevo df, por ejemplo:

df['a'].ix[index[0]]
>>> 1.452354

Para el índice entero:

df_index = df.index.values.tolist()
[df_index.index(i) for i in index]
>>> [3, 6]
diliop
fuente
1
Tan intuitivo como ixsuena, por algunas razones parece que se ha desaprobado en favor deiloc
cardamomo
145

Aquí hay una solución más simple:

inds = pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]

In [9]: df
Out[9]: 
          0         1
0  0.450319  0.062595
1 -0.673058  0.156073
2 -0.871179 -0.118575
3  0.594188       NaN
4 -1.017903 -0.484744
5  0.860375  0.239265
6 -0.640070       NaN
7 -0.535802  1.632932
8  0.876523 -0.153634
9 -0.686914  0.131185

In [10]: pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]
Out[10]: array([3, 6])
Wes McKinney
fuente
29
Terminé usando esto:np.where(df['b'].notnull())[0]
gracias, .nonzero()[0]es mejor que [i for i, k in enumerate(mask) if k].)
Ganand
2
Probablemente podría simplificar esto aún más:r, _ = np.where(df.isna())
cs95
2
agregar .to_numpy()para convertir en matriz numpy primero -pd.isnull(df).any(1).to_numpy().nonzero()
7bStan
13

Solución de una línea. Sin embargo, funciona solo para una columna.

df.loc[pandas.isna(df["b"]), :].index
Vasyl Vaskivskyi
fuente
Esto es lo que estaba buscando. Lo hice en una lista envolviéndolo de una manera list(...)como esta:list(df.loc[pandas.isna(df["b"]), :].index)
Daniel Butler
10

Y por si acaso, si desea encontrar las coordenadas de 'nan' para todas las columnas (suponiendo que todas sean numéricas), aquí tiene:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

df
   0  1  2    3    4  5
0  0  1  3  4.0  NaN  2
1  3  5  6  NaN  3.0  3

np.where(np.asanyarray(np.isnan(df)))
(array([0, 1]), array([4, 3]))
Filippo Mazza
fuente
9

No sé si es demasiado tarde, pero puede usar np.where para encontrar los índices de no valores como tales:

indices = list(np.where(df['b'].isna()[0]))
naturesenshi
fuente
4

Aquí hay pruebas para algunos métodos:

%timeit np.where(np.isnan(df['b']))[0]
%timeit pd.isnull(df['b']).nonzero()[0]
%timeit np.where(df['b'].isna())[0]
%timeit df.loc[pd.isna(df['b']), :].index

Y sus correspondientes tiempos:

333 µs ± 9.95 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
280 µs ± 220 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
313 µs ± 128 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
6.84 ms ± 1.59 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

Parece que pd.isnull(df['DRGWeight']).nonzero()[0]gana el día en términos de tiempo, pero cualquiera de los tres métodos principales tiene un rendimiento comparable.

Adam Erickson
fuente
3

en el caso de que tenga un índice de fecha y hora y desee tener los valores:

df.loc[pd.isnull(df).any(1), :].index.values
Amirkhm
fuente
2

Otra solución simple es list(np.where(df['b'].isnull())[0])

karthikeyan
fuente
1

Aquí hay otra toma más simple:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

inds = np.asarray(df.isnull()).nonzero()

(array([0, 1], dtype=int64), array([4, 3], dtype=int64))
cera de abejas nonya
fuente
1

Estaba buscando todos los índices de filas con valores NaN.
Mi solución de trabajo:

def get_nan_indexes(data_frame):
    indexes = []
    print(data_frame)
    for column in data_frame:
        index = data_frame[column].index[data_frame[column].apply(np.isnan)]
        if len(index):
            indexes.append(index[0])
    df_index = data_frame.index.values.tolist()
    return [df_index.index(i) for i in set(indexes)]
murthy10
fuente
0

Deje que el marco de datos se llame df y la columna de interés (es decir, la columna en la que estamos tratando de encontrar nulos ) sea 'b' . Luego, el siguiente fragmento da el índice deseado de nulo en el marco de datos:

   for i in range(df.shape[0]):
       if df['b'].isnull().iloc[i]:
           print(i)
Stone Austin
fuente