Estoy tratando de extraer los valores de batimetría de mi área de interés de una capa ráster de batimetría mundial utilizando la función 'rasterizar' en el paquete {sp}.
* Ediciones: Encontré la función 'extraer' que parece ser más lo que estoy buscando.
Esto es lo que he hecho hasta ahora:
> class(subarea0) #This is my area of interest (Eastern Canadian Arctic Sea)
[1] "SpatialPolygons"
attr(,"package")
[1] "sp"
> extent(subarea0)
class : Extent
xmin : -82.21997
xmax : -57.21667
ymin : 60.2
ymax : 78.16666
library(marelac)
data("Bathymetry")#World bathymetric data in library (marelac)
names(Bathymetry);class(Bathymetry);str(Bathymetry)
[1] "x" "y" "z"
[1] "list"
List of 3
$ x: num [1:359] -180 -179 -178 -177 -176 ...
$ y: num [1:180] -89.5 -88.5 -87.5 -86.5 -85.5 ...
$ z: num [1:359, 1:180] 2853 2873 2873 2873 2873 ...
raster_bath<-raster(Bathymetry)#Transformed into a raster layer
extent(raster_bath) <- extent(subarea0)#Transform the extend of my raster to the extend of my SpatialPolygons
>ras_sub0<-rasterize(subarea0,raster_bath)#rasterize my SpatialPolygons (*Edits: not the function that I need here, but I am still interested to learn what results mean)
Found 2 region(s) and 10 polygon(s)
> plot(ras_sub0)
> plot(subarea0, add=TRUE)
> ras_sub0
class : RasterLayer
dimensions : 180, 359, 64620 (nrow, ncol, ncell)
resolution : 0.06964709, 0.0998148 (x, y)
extent : -82.21997, -57.21667, 60.2, 78.16666 (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=longlat +ellps=WGS84
values : in memory
min value : 1
max value : 2
layer name : layer
No entiendo el resultado. ¿Por qué obtengo 2 colores para cada uno de mis polígonos? ¿Qué quieren decir?
¿Cómo puedo obtener finalmente el contorno de profundidad de batimetría? ¿Tiene esto algo que ver con mi resolución o con cambiar las dimensiones?
* Ediciones: ok, ahora he hecho lo siguiente:
v <- extract(raster_bath, subarea0)#Extract data from my Raster Layer for the locations of my SpatialPolygons
v es una lista y no estoy seguro de cómo / bajo qué forma volver a vincular esta información con mi polígono espacial ...
¡Gracias!
Respuestas:
Su línea
ras_sub0<-rasterize(subarea0,raster_bath)
solo toma el número de índice de los polígonos y lo asigna a los valores del ráster.Si desea solo la intersección de su polígono y el ráster:
Actualización : como señala @GodinA, parece que intersect () a veces no devuelve un ráster que tiene la extensión completa del polígono. Para evitar esto, puede cruzarse con un ráster un poco más grande que el original:
fuente
cont <- contour(r3)
entonceslines(cont)
¿No es genial R?Aquí hay otra solución, usando una función básica de subconjunto en
raster
.fuente