R gstat krige () - Matriz de covarianza singular en la ubicación [5.88,47.4,0]: omitiendo

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Cuando quiero realizar el kriging solo funciona a veces, dependiendo de los valores que use en mi tabla de datos. Como resultado de la función krige que obtengo var1.pred: NA NA NA ...y var1.var: NA NA NA ...(pero solo cuando uso los valores "incorrectos" en mi tabla de datos).

Por ejemplo:

  • que funciona siempre (hasta ahora) cuando sólo uso 10 valores
  • que funciona cuando se utiliza 50 valores, pero sólo con ciertas personas
  • no funciona cuando uso 50 valores y los valores "incorrectos"
  • que funciona cuando se utiliza 25 valores y los valores "mal" antes mencionados

No entiendo por qué a veces funciona y otras no. Lo extraño es que cuando agrego Zwiesel;49.02999878;13.22999954;2.2a la tabla de datos funciona cuando uso menos de ~ 20 valores, pero no funciona cuando uso más de 50 valores ...

¿Dónde está mi error?

myWeatherTable.csv:

Place;Latitude;Longitude;Temperature
Aachen;50.77999878;6.09999990;3
Abbikenhausen;53.52999878;8.00000000;7.9
Adelbach;49.04000092;9.76000023;3.1
Adendorf;51.61999893;11.69999981;1.9
Alberzell;48.45999908;11.34000015;4.6
...
...

Mi código para realizar la interpolación de kriging

WeatherData <- read.csv(file="myWeatherTable", header = TRUE, sep ";")

coordinates(WeatherData) = ~Longitude + Latitude

vario <-  variogram(log(Temperature) ~1, WeatherData)
vario.fit <- fit.variogram(vario, vgm("Sph"))

min_lon <- min(WeatherData$Longitude)
max_lon <- max(WeatherData$Longitude)
min_lat <- min(WeatherData$Latitude)
max_lat <- max(WeatherData$Latitude)
Longitude.range <- as.numeric(c(min_lon,max_lon))
Latitude.range <- as.numeric(c(min_lat,max_lat))
grd <- expand.grid(Longitude = seq(from = Longitude.range[1], to = Longitude.range[2], by = 0.1),
  Latitude = seq(from = Latitude.range[1],to = Latitude.range[2], by = 0.1))
coordinates(grd) <- ~Longitude + Latitude
gridded(grd) <- TRUE

plot1 <- WU_data_spatial %>% as.data.frame %>%
  ggplot(aes(Longitude, Latitude)) + geom_point(size=1) + coord_equal() + 
  ggtitle("Points with measurements")

plot2 <- grd %>% as.data.frame %>%
  ggplot(aes(Longitude, Latitude)) + geom_point(size=1) + coord_equal() + 
  ggtitle("Points at which to estimate")

grid.arrange(plot1, plot2, ncol = 2)

kriged <- krige(Temperature~ 1, WeatherData, grd, model=variogram_fit)

Advertencias :

1: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [5.88,47.4,0]: skipping...
2: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [5.98,47.4,0]: skipping...
3: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [6.08,47.4,0]: skipping...
4: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [6.18,47.4,0]: skipping...
...
...
obrob
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Respuestas:

16

Este error se devuelve comúnmente porque tiene ubicaciones duplicadas. Puede verificar esto usando la sp::zerodistfunción.

Para eliminar ubicaciones duplicadas, llame sp::zerodistdentro de un índice de paréntesis.

WeatherData <- WeatherData[-zerodist(WeatherData)[,1],] 
Jeffrey Evans
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