Hay varias posibles explicaciones para la causa del bombardeo pesado tardío. Uno de ellos incluye una estrella que pasa que perturbó la nube de Oort. Sin embargo, una "colisión del sistema estelar" habría destruido el sistema solar. Si bien las galaxias están en su mayoría vacías y una colisión galáctica no implicará tantas colisiones reales (si las hay), las interacciones gravitacionales entre las galaxias realmente cambian las órbitas de las estrellas alrededor de los centros galácticos. Del mismo modo, una "colisión del sistema estelar" cambiaría en gran medida las órbitas planetarias, incluso si al principio no hubo colisiones.
Otra hipótesis es totalmente "interior": una resonancia orbital 2: 1 entre Júpiter y Saturno cambió las órbitas de Neptuno y Urano, pudiendo incluso hacer que intercambien posiciones. La nueva órbita de Neptuno afectó a muchos objetos del cinturón de Kuiper, ya sea enviándolos a formar o unirse a la nube de Oort, o enviándolos como parte del bombardeo pesado tardío.