Procesando dos archivos usando awk

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Leí Comparar dos archivos usando Unix y Awk . Es realmente interesante Lo leí y probé, pero no puedo entenderlo completamente y usarlo en otros casos.

Tengo dos archivos file1tiene un campo y el otro tiene 16 campos. Quiero leer elementos de file1 y compararlos con el tercer campo de file2. Si hubo una coincidencia para cada elemento, sumo el valor del campo 5 en file2. Como ejemplo:

archivo 1

1
2
3

archivo 2

2 2 2 1 2
3 6 1 2 4 
4 1 1 2 3
6 3 3 3 4 

Para el elemento 1 en file1Quiero agregar valores en el campo 5 de file2donde el valor del campo 3 es 1. Y hacer lo mismo para el elemento 2 y 3 en file1. La salida para 1 es (3 + 4 = 7) y para 2 es 2 y para 3 es 4.

No sé cómo debería escribirlo con awk.

usuario55340
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Respuestas:

20

Aquí hay una manera. Lo he escrito como un script awk para poder agregar comentarios:

#!/usr/local/bin/awk -f

{
    ## FNR is the line number of the current file, NR is the number of 
    ## lines that have been processed. If you only give one file to
    ## awk, FNR will always equal NR. If you give more than one file,
    ## FNR will go back to 1 when the next file is reached but NR
    ## will continue incrementing. Therefore, NR == FNR only while
    ## the first file is being processed.
    if(NR == FNR){
      ## If this is the first file, save the values of $1
      ## in the array n.
      n[$1] = 0
    }
    ## If we have moved on to the 2nd file
    else{
      ## If the 3rd field of the second file exists in
      ## the first file.
      if($3 in n){
        ## Add the value of the 5th field to the corresponding value
        ## of the n array.
        n[$3]+=$5
      }
    }
}
## The END{} block is executed after all files have been processed.
## This is useful since you may have more than one line whose 3rd
## field was specified in the first file so you don't want to print
## as you process the files.
END{
    ## For each element in the n array
    for (i in n){
    ## print the element itself and then its value
    print i,":",n[i];
    }
}

Puede guardarlo como un archivo, hacerlo ejecutable y ejecutarlo así:

$ chmod a+x foo.awk
$ ./foo.awk file1 file2
1 : 7
2 : 2
3 : 4

O bien, puede condensarlo en una sola línea:

awk '
     (NR == FNR){n[$1] = 0; next}
     {if($3 in n){n[$3]+=$5}}
     END{for (i in n){print i,":",n[i]} }' file1 file2
terdon
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awk '
  NR == FNR {n[$3] += $5; next}
  {print $1 ": " n[$1]}' file2 file1
Stéphane Chazelas
fuente
Realiza un trabajo extra sumando campos no coincidentes.
Emmanuel
@Emmanuel, esas son todavía unas instrucciones awk por línea de archivo2, lo que lo hace más corto y más rápido que el de terdon
Stéphane Chazelas
solución brillante!
Ronald Pauffert