¿Cómo puedo convertir una biblioteca de música WAV de iTunes a FLAC desde la línea de comandos?

Tengo una gran biblioteca de música que actualmente administra iTunes en Windows. Cuando comencé hace 5 o 6 años al copiar mi música a mis PC, tenía una comprensión bastante básica de los formatos de audio, y elegí arbitrariamente copiar todos mis CD al formato WAV. Así que ahora tengo más de 1 TB...