Ubuntu Server Team recomienda esta opción 2:
1.- Servidor OpenSSH
2.- eBox es un marco web utilizado para administrar la configuración de la aplicación del servidor. El diseño modular de eBox le permite elegir qué servicios desea configurar con eBox.
ver detalles aquí
3.- en ubuntu server 10.10 ebox fue cambiado con Puppet es un marco multiplataforma que permite a los administradores del sistema realizar tareas comunes usando código. El código puede realizar una variedad de tareas, desde la instalación de un nuevo software, hasta la verificación de permisos de archivos o la actualización de cuentas de usuario. Puppet es excelente no solo durante la instalación inicial de un sistema, sino también durante todo el ciclo de vida del sistema. En la mayoría de los casos, Puppet se utilizará en una configuración cliente / servidor. más detalles aquí
4.- en ubuntu server 12.04, el equipo presenta Zentyal es un servidor Linux para pequeñas empresas, que se puede configurar como Gateway, Infrastructure Manager, Unified Threat Manager, Office Server, Unified Communication Server o una combinación de ellos. Zentyal consta de una serie de paquetes (generalmente uno para cada módulo) que proporcionan una interfaz web para configurar los diferentes servidores o servicios. La configuración se almacena en una base de datos Redis de valor clave, pero la configuración relacionada con usuarios, grupos y dominios está en OpenLDAP. más detalles aquí
Sí, estás buscando Webmin . Puede administrar el sistema completo con esta interfaz web.
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ispconfig es otra buena opción para controlar esas actividades de forma remota
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