En Ubuntu 14.04, la barra de título de mi aplicación se encuentra debajo de la barra de título principal de Unity.
En la imagen a continuación, la ventana seleccionada es de Download Manager, pero su barra de título está oculta debajo de la barra de título superior de unity.
Encuentro que este problema ocurre con aplicaciones web y aplicaciones independientes.
Idealmente debería verse así: