Para agregar una carpeta de Descargas a la barra de favoritos en Gnome Shell:
cp /usr/share/applications/nautilus.desktop ~/.local/share/applications/downloads.desktop
nano downloads.desktop
Configuré las primeras 4 líneas para:
Name=Downloads
Comment=Access and organize your downloads
Exec=nautilus Downloads
Icon=folder-download
Ahora haga uno de los siguientes:
Salga y vuelva a entrar. O,
Ejecute esto en una ventana de Terminal:
nautilus -q
Luego abra el Lanzador de aplicaciones con Alt+ F2y ejecute:
nautilus
Busque Descargas en el Tablero y luego arrastre el acceso directo de Aplicaciones (como vio, el acceso directo de Lugares no funcionará) a la barra de favoritos.
Puede buscar otros nombres de íconos buscando, /usr/share/icons/Humanity/places/24/por ejemplo.
Por defecto, Nautilus intentará abrir nombres de ruta en su directorio de inicio. Si desea acceder a una carpeta que no está en su directorio de inicio, simplemente coloque la ruta completa (como /etc/apt)
Por cierto, los favoritos se almacenan en org.gnome.shell favorite-apps. Prefiero usar dconf-editor para navegar y ajustar cosas, pero también puede usar gsettings directamente desde la línea de comandos.
¡Gracias @fossfreedom por la ayuda!