Quiero saber por qué se ejecuta el demonio nombrado, ¿necesito que se ejecute para que mi VPS funcione correctamente?
¿Puedo detenerlo o eliminarlo?

/usr/sbin/namedes proporcionado por el bind9paquete. bind9es un servidor DNS Si se trata de un VPS, es muy posible que necesite ese paquete. Pero probablemente pueda eliminarlo y ver qué sucede, y luego volver a colocarlo si lo necesita.
sudo apt-get remove bind9
La eliminación puede querer eliminar otros paquetes, incluidos los bastante importantes para usted. Así que asegúrese de prestar atención a eso antes de proceder con la eliminación. Esto también puede revelar por qué bind9está instalado; puede ser una dependencia de otros paquetes que está utilizando.
Tenga en cuenta que no estoy diciendo que debería estar haciendo esto, solo que probablemente pueda, si lo desea. Si hace esto, incluso si el servidor deja de funcionar correctamente, probablemente todavía podrá acceder a Internet para descargar y reinstalar el paquete. Sin embargo, es posible que no pueda hacerlo, o que no pueda volver a SSH al servidor si su conexión se interrumpe. (Gracias a tgm4883 por señalar esto).
Puede mitigar sustancialmente el riesgo de problemas asegurándose de tener los .debarchivos necesarios en caché para reinstalar bind9y sus dependencias:
sudo apt-get --download-only --reinstall install bind9
Si lo ha ejecutado recientemente, y no lo ha hecho sudo apt-get cleandesde entonces, debería poder reinstalarlo bind9 incluso si no puede conectarse a los servidores de descarga de Ubuntu después de eliminarlo :
sudo apt-get install bind9
Es posible que deba ejecutar sudo apt-get updateantes de cualquiera de los dos comandos anteriores.
Si no desea eliminarlo bind9en absoluto, pero solo vea qué se eliminaría si lo hiciera (lo que puede revelar por qué está instalado), puede simular su eliminación:
apt-get -s remove bind9