Puede hacerlo, pero la ventana debe tener una clase / nombre / título / id únicos o algo a lo que pueda hacer referencia.
Inicie la configuración de Compiz:
% ccsm
Seleccione el complemento "Colocar Windows"
Asegúrate de que esté habilitado
Seleccione la pestaña "Colocación de ventana fija"
Luego haga clic en "Nuevo" en "Windows con posiciones fijas".
Ahora debe especificar qué ventanas tienen qué posiciones fijas. Haga clic en el signo "+" para que aparezca un cuadro de diálogo de selección de ventana, esto le permitirá especificar la ventana por clase / título / etc. Puede elegir uno de los tipos y tomar la ventana para ver cuál es su valor. si es algo único, puede usarlo para la colocación. Puede agregar múltiples condiciones y, por lo tanto, terminar con combinaciones interesantes como:
(class=myterminal) & title=one
Luego, especifique sus posiciones X e Y, guárdelo y cierre el administrador de configuración. La próxima vez que coloque una ventana que se ajuste a la definición que ha especificado, debe colocarla en la ubicación adecuada (es posible que deba "compilar - reemplazar" aunque lo dudo).