Eliminar archivos del cliente secundario BTSync Los archivos permanecen en Ubuntu VPS pero son invisibles

Instalé BTSync en mi VPS que ejecuta Ubuntu 13.10. Configuré una carpeta de entrega donde transferiría mis archivos y eso se sincronizaría con la PC de mi casa. Luego eliminaría las cosas en mi PC de casa (no en el dispositivo principal, que es mi VPS) y si ls -la mostraría la carpeta como vacía. Ayer descubrí que estaba usando el 99% de mi almacenamiento. Había un archivo existente que no se eliminó. Así que lo eliminé a través de SSH y borró el espacio, pero todavía estoy usando el 60% del almacenamiento de mi VPS a pesar de estar solo al 5% antes de comenzar a hacer transferencias de esta manera.

¿Es posible encontrar estos archivos a pesar de que ya no figuran en la carpeta? He intentado buscar en SuperUser y otros sitios, pero no puedo encontrar la respuesta. Incluso le pregunté a mi amigo certificado de Ubuntu y él no tenía idea.

La respuesta es NO eliminar de forma remota. Al hacerlo, se elimina el archivo remoto y aparece el puntero al archivo local del que se realizó la copia de seguridad. Un simple LS mostró todos mis archivos todavía allí, solo ocultos.

Lo siento, olvidé por completo que publiqué esta pregunta hasta ahora.