De Princeton WordNet :
S: (n) paginación , folio, número de página, paginación (el sistema de numeración de páginas)
Eso explica todo el shebang. Básicamente: tome cualquier cosa arbitrariamente larga y divídala en páginas.
Un archivo no paginado, aunque nunca he visto uno, sería solo una secuencia de contenido, mientras que uno paginado obviamente consistiría en un número contable de páginas.
Tome un navegador que muestre una página HTML como analogía: no está paginado. Cuando decide imprimirlo, se vuelve paginado debido a la forma en que funcionan nuestras impresoras y los humanos elegimos leer hoy en día. La parte difícil, por supuesto, es definir dónde deben comenzar y finalizar las páginas, y el hecho de que con la paginación, crea límites lógicos o físicos que no existían antes.
Por otra parte, el problema de trabajar con contenido no paginado es que la mayoría del software actual se basa en la paginación, desde Word hasta Acrobat. PDF no parece apoyar esto. DjVu podría, aunque no encontré una prueba y no tengo experiencia con DjVu.