¿Existe algún método para construir árboles de decisión que tenga en cuenta los predictores estructurados / jerárquicos / multinivel, que me permitan imponer conocimientos de dominio o restricciones en las interacciones, por ejemplo?
Si tiene respuestas métricas, hay un árbol RE-EM de Sela y Simonoff (Machine Learning, 86, 169-207). El paquete R se llama REEMtree. Está destinado a datos de panel con efectos aleatorios, pero también debería poder usarlo para otros datos jerárquicamente anidados / multinivel.
Si está de acuerdo con incluir la experiencia del dominio en un modelo de efectos fijos, también puede usar la partición recursiva basada en modelos con la party::mobfunción.