zcat / gzcat funciona en linux, no en osx. compatibilidad general de linux / osx

Primero, el problema específico: en Linux, uso zcat para listar un archivo .zip. En osx, zcat parece agregar automáticamente .Z al nombre del archivo. Varias personas sugieren reemplazar zcat con gzcat; ¡Sin embargo, gzcat se queja de que el archivo no está en formato gzip!

'archivo' muestra esto: ... Zip datos de archivo, al menos v2.0 para extraer

Entonces, ni zcat ni gzcat funcionarán en osx, ¿qué puedo hacer?

Tengo un script de tamaño mediano en bash que usa zcat / gzcat, sed awk y otras utilidades básicas para procesar una cantidad de archivos. Me gustaría duplicar ese entorno en mi computadora portátil osx para poder trabajar sin conexión. ¿Alguna sugerencia general de cómo puedo evitar ese dolor? Espero que este sea un flujo de trabajo bastante rutinario, por lo que debe haber sido resuelto por otros.

Tienes razón. Es un comportamiento molesto.

$ zcat foo.txt.gz 
zcat: can't stat: foo.txt.gz (foo.txt.gz.Z): No such file or directory

Prueba esto:

$ zcat < foo.txt.gz 
asdfadsf

Sé que esta es una vieja pregunta. Sin embargo, encontré una solución de un hilo de github aún más antiguo .

Simplemente puede usar gunzip -ceso funciona de manera similar a zcatsin los errores en Mac OS X.

$ gunzip -c 20150707_backup.sql.gz | mysql -u mysql_user -p

Puede instalar utilidades GNU para Mac OS X, por ejemplo, usando homebrew (ejecutar brew install coreutils gnu-sed, que instala gzcatet al. Y gsed). Esto le proporcionará la implementación de GNU de cada comando.

Luego, para facilitarle la vida, haga una variable para cada comando (por ejemplo sed=gsed, y úsela $sedposteriormente), o simplemente alínelos (por ejemplo alias sed=gsed) en cualquier script que escriba. He escrito un Gist sobre esto para su conveniencia: gnu-tools-for-mac.sh . Ponga (o incluya) este código en la parte superior de sus scripts.

Utilice la implementación de GNU para comprimir y extraer los archivos. Yo diría que no puedes mezclar los usos de la implementación de OS X y GNU.

¡Acabo de probar esto y encontré algo muy interesante! Para los gzarchivos, se espera que se ejecuten gzcaten Mac OS.

Solución 1

• Uso gzcat /path/to/file.gzy debería funcionar.
• Usar zcat /path/to/file.gzte dará un error.

Solución 2

• Instale el archivo en zcaty funcionará.
• Por ejemplo, cat /path/to/file.gz | zcatfuncionará.

¡Espero que esto ayude!

La versión de Mac OS X gzip(1) no admite la lectura de archivos zip . Desde la página del manual:

Esta versión de gzip también es capaz de descomprimir archivos comprimidos usando compress(1)o bzip2(1).

Pero la versión de Linux (GNU) sí .

gunzipActualmente se pueden descomprimir archivos creados por gzip, zip, compress, compress -Ho pack.

Los terceros han empaquetado GNU gzip para Mac OS X; Puede encontrarlos en una búsqueda web. Ese es probablemente el camino de menor resistencia.

Es curioso, tuve el mismo problema al ejecutar un bash-script bash somescript.sh, que ejecutó un bucle for gzcatdentro. Pero probando estas cosas dentro del somescript.sh-script ...:

1. zcat < file.txt.gz
2. Ya había instalado brew install coreutils, pero no obstante, reinstalé:brew reinstall coreutils
3. gunzip -c file.txt.gz

... ascendió a nada ...

Pero también usé una referencia a un directorio:

SOMEDIR="~/DIR1/DIR2/DATA"

Lo cual se interpreta como ~/DIR1/DIR2/DATAy aparentemente no funciona dentro del bashscript dentro macOS. Esto funcionó:

SOMEDIR="${HOME}/DIR1/DIR2/DATA"

Lo cual se interpreta como /Users/someuser/DIR1/DIR2/DATA. No sé por qué, no soy un experto en macOS-BASH-techie, pero funcionó junto con mi código original ...

gzcat file.txt.gz | awk '{ print $1, $2, $3, $4, $5, $6 }' > ${SOMEDIR}/new.file.txt.

... dentro de mi somescript.sh-script.

Quizás sea útil para alguien.

Mejor,

Lijadora