Como dice Jim, los ejemplos en el sitio OpenVPN usan # para comentarios y; para comentar la configuración. No existe una diferencia funcional, pero esta convención facilita la identificación visual de las configuraciones que están comentadas.
De https://openvpn.net/index.php/open-source/documentation/howto.html#examples
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# Sample OpenVPN 2.0 config file for #
<snip>
# Comments are preceded with '#' or ';' #
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# Which local IP address should OpenVPN
# listen on? (optional)
;local a.b.c.d
# Which TCP/UDP port should OpenVPN listen on?
# If you want to run multiple OpenVPN instances
# on the same machine, use a different port
# number for each one. You will need to
# open up this port on your firewall.
port 1194
# TCP or UDP server?
;proto tcp
proto udp
;
: nunca antes había visto un estilo de comentario específico para el código deshabilitado (en oposición al texto)