Además del daño físico (pisando sobre él), ¿hay algo que pueda hacerle al Pi que pueda dañarlo irreversiblemente?
Más específicamente, ¿cualquier cosa que pueda hacer con el código, o al sacar prematuramente la tarjeta SD (sé que esto puede dañar la tarjeta SD), dañará el Pi?

Se podría overclock el RPI a través
over_voltage. Overclockingarm_freqygpu_freqes compatible, peroover_voltagepuede dañar la CPU y anulará la garantía. Lo haces a través de tu config.txt . Aquí hay una pregunta relacionada que brinda un poco más de información sobre el overclocking y sus peligros.fuente