¿Python SciPy necesita BLAS?

numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError: 
    Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.
    Directories to search for the libraries can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting
    the BLAS environment variable.

¿Qué tar necesito descargar de este sitio?

He probado los fortrans, pero sigo recibiendo este error (después de configurar la variable de entorno, obviamente).

La página web de SciPy solía proporcionar instrucciones de compilación e instalación, pero las instrucciones ahora se basan en distribuciones binarias del sistema operativo. Para compilar SciPy (y NumPy) en sistemas operativos sin paquetes precompilados de las bibliotecas requeridas, debe compilar y luego vincular estáticamente a las bibliotecas Fortran BLAS y LAPACK :

mkdir -p ~/src/
cd ~/src/
wget http://www.netlib.org/blas/blas.tgz
tar xzf blas.tgz
cd BLAS-*

## NOTE: The selected Fortran compiler must be consistent for BLAS, LAPACK, NumPy, and SciPy.
## For GNU compiler on 32-bit systems:
#g77 -O2 -fno-second-underscore -c *.f                     # with g77
#gfortran -O2 -std=legacy -fno-second-underscore -c *.f    # with gfortran
## OR for GNU compiler on 64-bit systems:
#g77 -O3 -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f                     # with g77
gfortran -O3 -std=legacy -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f    # with gfortran
## OR for Intel compiler:
#ifort -FI -w90 -w95 -cm -O3 -unroll -c *.f

# Continue below irrespective of compiler:
ar r libfblas.a *.o
ranlib libfblas.a
rm -rf *.o
export BLAS=~/src/BLAS-*/libfblas.a

Ejecute solo uno de los cinco comandos g77 / gfortran / ifort. He comentado todo, pero el gfortran que uso. La instalación posterior de LAPACK requiere un compilador Fortran 90 , y dado que ambas instalaciones deben usar el mismo compilador Fortran, g77 no debe usarse para BLAS.

A continuación, deberá instalar el material LAPACK. Las instrucciones de la página web de SciPy también me ayudaron aquí, pero tuve que modificarlas para adaptarlas a mi entorno:

mkdir -p ~/src
cd ~/src/
wget http://www.netlib.org/lapack/lapack.tgz
tar xzf lapack.tgz
cd lapack-*/
cp INSTALL/make.inc.gfortran make.inc          # On Linux with lapack-3.2.1 or newer
make lapacklib
make clean
export LAPACK=~/src/lapack-*/liblapack.a

Actualización el 3 de septiembre de 2015: verificó algunos comentarios hoy (gracias a todos): antes de ejecutar, make lapacklibedite el make.incarchivo y agregue la -fPICopción OPTSy la NOOPTconfiguración. Si está en una arquitectura de 64 bits o desea compilar una, también agregue -m64. Es importante que BLAS y LAPACK se compilen con estas opciones configuradas con los mismos valores. Si olvida que -fPICSciPy en realidad le dará un error sobre los símbolos que faltan y recomendará este interruptor. La sección específica de se make.incve así en mi configuración:

FORTRAN  = gfortran 
OPTS     = -O2 -frecursive -fPIC -m64
DRVOPTS  = $(OPTS)
NOOPT    = -O0 -frecursive -fPIC -m64
LOADER   = gfortran

En máquinas antiguas (p. Ej., RedHat 5), gfortran podría instalarse en una versión anterior (p. Ej., 4.1.2) y no comprende la opción -frecursive. Simplemente elimínelo del make.incarchivo en tales casos.

El objetivo de prueba lapack del Makefile falla en mi configuración porque no puede encontrar las bibliotecas de blas. Si es minucioso, puede mover temporalmente la biblioteca de blas a la ubicación especificada para probar el paquete. Soy una persona perezosa, así que confío en los desarrolladores para que funcione y verifique solo en SciPy.

Si necesita usar las últimas versiones de SciPy en lugar de la versión empaquetada, sin pasar por la molestia de construir BLAS y LAPACK, puede seguir el siguiente procedimiento.

Instalar bibliotecas de álgebra lineal desde el repositorio (para Ubuntu),

sudo apt-get install gfortran libopenblas-dev liblapack-dev

Luego instale SciPy, (después de descargar la fuente SciPy): python setup.py installo

pip install scipy

Según el caso puede ser.

En Fedora, esto funciona:

 yum install lapack lapack-devel blas blas-devel
 pip install numpy
 pip install scipy

Recuerde instalar ' lapack-devel ' y ' blas-devel ' además de 'blas' y 'lapack'; de lo contrario, obtendrá el error que mencionó o el error "numpy.distutils.system_info. LapackNotFoundError ".

Supongo que estás hablando de instalación en Ubuntu. Solo usa:

apt-get install python-numpy python-scipy

Eso también debería ocuparse de la compilación de bibliotecas BLAS. De lo contrario, compilar las bibliotecas BLAS es muy difícil.

Para los usuarios de Windows hay un buen paquete binario de Chris (advertencia: es una descarga bastante grande, 191 MB):

• http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#scipy-stack

Seguir las instrucciones dadas por 'cfi' funciona para mí, aunque hay algunas piezas que dejaron fuera que pueda necesitar:

1) Su directorio lapack, después de descomprimir, puede llamarse lapack-XY (algún número de versión), por lo que puede cambiarle el nombre a LAPACK.

cd ~/src
mv lapack-[tab] LAPACK

2) En ese directorio, es posible que deba hacer:

cd ~/src/LAPACK 
cp lapack_LINUX.a libflapack.a

Intenta usar

sudo apt-get install python3-scipy