¿Cómo hacer un diagrama de dispersión con círculos vacíos en Python?

En Python, con Matplotlib, ¿cómo se puede trazar un diagrama de dispersión con círculos vacíos ? El objetivo es dibujar círculos vacíos alrededor de algunos de los discos de colores ya trazados scatter(), para resaltarlos, idealmente sin tener que volver a dibujar los círculos de colores.

Lo intenté facecolors=None, pero fue en vano.

De la documentación para dispersión:

Optional kwargs control the Collection properties; in particular:

    edgecolors:
        The string ‘none’ to plot faces with no outlines
    facecolors:
        The string ‘none’ to plot unfilled outlines

Intenta lo siguiente:

import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np 

x = np.random.randn(60) 
y = np.random.randn(60)

plt.scatter(x, y, s=80, facecolors='none', edgecolors='r')
plt.show()

Nota: Para otros tipos de parcelas, vea esta publicación sobre el uso de markeredgecolory markerfacecolor.

¿Funcionarían estos?

plt.scatter(np.random.randn(100), np.random.randn(100), facecolors='none')

o usando plot ()

plt.plot(np.random.randn(100), np.random.randn(100), 'o', mfc='none')

Aquí hay otra forma: esto agrega un círculo a los ejes actuales, la trama o la imagen o lo que sea:

from matplotlib.patches import Circle  # $matplotlib/patches.py

def circle( xy, radius, color="lightsteelblue", facecolor="none", alpha=1, ax=None ):
    """ add a circle to ax= or current axes
    """
        # from .../pylab_examples/ellipse_demo.py
    e = Circle( xy=xy, radius=radius )
    if ax is None:
        ax = pl.gca()  # ax = subplot( 1,1,1 )
    ax.add_artist(e)
    e.set_clip_box(ax.bbox)
    e.set_edgecolor( color )
    e.set_facecolor( facecolor )  # "none" not None
    e.set_alpha( alpha )

(Los círculos en la imagen se convierten en elipses porque imshow aspect="auto").

En matplotlib 2.0 hay un parámetro llamado fillstyle que permite un mejor control sobre la forma en que se llenan los marcadores. En mi caso lo he usado con barras de error pero funciona para marcadores en general http://matplotlib.org/api/_as_gen/matplotlib.axes.Axes.errorbar.html

fillstyleacepta los siguientes valores: ['full' | 'izquierda' | 'derecho' | 'fondo' | 'top' | 'ninguna']

Hay dos cosas importantes a tener en cuenta al usar fillstyle,

1) Si mfc se establece en cualquier tipo de valor, tendrá prioridad, por lo tanto, si configuró el estilo de relleno en 'ninguno', no tendría efecto. Así que evite usar mfc en conjunción con el estilo de relleno

2) Es posible que desee controlar el ancho del borde del marcador (usando markeredgewidtho mew) porque si el marcador es relativamente pequeño y el ancho del borde es grueso, los marcadores se verán rellenos aunque no lo estén.

El siguiente es un ejemplo usando barras de error:

myplot.errorbar(x=myXval, y=myYval, yerr=myYerrVal, fmt='o', fillstyle='none', ecolor='blue',  mec='blue')

Basándose en el ejemplo de Gary Kerr y como se propone aquí, uno puede crear círculos vacíos relacionados con valores especificados con el siguiente código:

import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np 
from matplotlib.markers import MarkerStyle

x = np.random.randn(60) 
y = np.random.randn(60)
z = np.random.randn(60)

g=plt.scatter(x, y, s=80, c=z)
g.set_facecolor('none')
plt.colorbar()
plt.show()

Así que supongo que desea resaltar algunos puntos que se ajustan a ciertos criterios. Puede usar el comando Prelude para hacer un segundo diagrama de dispersión de los puntos resaltados con un círculo vacío y una primera llamada para trazar todos los puntos. Asegúrese de que el parámetro s sea lo suficientemente pequeño para que los círculos vacíos más grandes encierren los más pequeños llenos.

La otra opción es no usar dispersión y dibujar los parches individualmente usando el comando circle / ellipse. Estos están en matplotlib.patches, aquí hay un código de muestra sobre cómo dibujar círculos, rectángulos, etc.