GraphViz - ¿Cómo conectar subgrafos?

En el DOTlenguaje para GraphViz, estoy tratando de representar un diagrama de dependencia. Necesito poder tener nodos dentro de un contenedor y poder hacer que los nodos y / o contenedores dependan de otros nodos y / o contenedores.

Estoy usando subgraphpara representar mis contenedores. La vinculación de nodos funciona bien, pero no puedo entender cómo conectar subgráficos.

Dado el programa a continuación, necesito poder conectarme cluster_1y cluster_2con una flecha, pero todo lo que he intentado crea nuevos nodos en lugar de conectar los grupos:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana"];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Renders fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Both of these create new nodes
    cluster_1 -> cluster_2;
    "Container A" -> "Container C";
}

El manual del usuario del DOT ofrece el siguiente ejemplo de un gráfico con grupos con bordes entre grupos:

IMPORTANTE: compound=truese requiere la declaración inicial .

digraph G {
  compound=true;
  subgraph cluster0 {
    a -> b;
    a -> c;
    b -> d;
    c -> d;
  }
  subgraph cluster1 {
    e -> g;
    e -> f;
  }
  b -> f [lhead=cluster1];
  d -> e;
  c -> g [ltail=cluster0,lhead=cluster1];
  c -> e [ltail=cluster0];
  d -> h;
}

... y bordes entre nodos y grupos:

Para facilitar la referencia, la solución descrita en la respuesta de HighPerformanceMark, aplicada directamente a la pregunta original, se ve así:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana" compound=true];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Edges between nodes render fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Edges that directly connect one cluster to another
    "Item 1" -> "Item 3" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_1];
    "Item 1" -> "Item 5" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_2];
}

El compound=trueen la graphdeclaración es vital. Eso produce salida:

Tenga en cuenta que cambié los bordes a los nodos de referencia dentro del clúster, agregué los atributos ltail y lhead a cada borde, especificando el nombre del clúster y agregué el atributo de nivel de gráfico 'compuesto = verdadero'.

Con respecto a la preocupación de que uno quiera conectar un clúster sin nodos dentro de él, mi solución ha sido siempre agregar un nodo a cada clúster, representado con estilo = texto sin formato. Use este nodo para etiquetar el clúster (en lugar del atributo de "etiqueta" incorporado del clúster, que debe establecerse en la cadena vacía (en Python label='""'). Esto significa que ya no agrego bordes que conectan los clústeres directamente, pero Funciona en mi situación particular.

Asegúrese de estar utilizando el fdpdiseño para el archivo. No creo que neatoadmita grupos.