En mis emacs (24.5.1) tengo ambos y no estoy seguro de qué es qué. ggtags se instaló a través list-packagesde melpa.
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IIRC se gtags-modeenvía como parte de GNU Global y proporciona un conjunto básico de comandos y enlaces de teclas para usar Global. ggtagshace casi lo mismo pero es un paquete mucho más completo con muchas más funciones. Inicialmente, encontré que algunas de las combinaciones de teclas de ggtags son un poco confusas (especialmente después de realizar una operación de búsqueda de etiquetas), pero a la larga probablemente será una mejor solución que simple gtags-mode.