Por extraño que parezca, he tenido un problema extremadamente similar. Había una pequeña barra que apareció debajo del Dock en mi escritorio, casi siempre que el Dock sea ancho (mi Dock es vertical) y con esquinas redondeadas. Era negro, y los puntos de la aplicación en ejecución en mi Dock también son negros (mientras que el tuyo es gris y la barra es gris).
La actualización de 10.10.1 a 10.10.2 hizo que desapareciera. Luego reapareció, junto con una segunda. Sobrevivió a los reinicios. No pensé que en realidad fuera parte del Dock, porque se quedó en el mismo lugar cuando moví el Dock desde el lado derecho de la pantalla hacia la parte inferior. Aunque, cuando apareció el segundo, y pasé el cursor sobre el dock (activando la ampliación de los íconos), permaneció sobre los íconos en el lado de la aplicación del dock, y estaba debajo de los íconos en el lado de la Papelera del dock .
Finalmente ejecuté este comando de terminal para matar el Dock, y cuando se reinició, las barras desaparecieron. Ha pasado un día y no han reaparecido. Dedos cruzados. Supongo que esto es un error en Yosemite.
killall -KILL Dock